本作主人公为高中生，也是假面骑士史上年龄较小的骑士，口头禅为“宇宙来了”。这是假面骑士系列第一次以高中校园作为故事舞台，以高中生作为主角。主角如月弦太朗是转校生，梳着飞机头，梦想是“与学校的所有人成为朋友”。他的同班同学歌星贤吾，拥有神秘的天文开关和月球基地——玉兔舱。二人的相遇，促使了假面骑士卌骑的诞生！弦太朗与朋友…

遥远的古代，曾经被人们称作"恶魔"的三剑侠（アクマイザー）：撒旦、伊尔与盖拉经过数千年的沉睡，终于开始幽幽醒来。凭借着来自人类精神世界Under World的魔力相助，被历代假面骑士消灭的怪人们相继复活，协助三剑侠实现自太古时代便图谋称霸大地的野心。三剑侠的邪恶计划即将完成， Fourze、Meteor、Wizard、OOO等八名假…

亚利西亚联邦研发的宇宙铁人——空迪因和陆迪因突然萌发了自主意识，他们袭击了布林克博士，意图实行反人类计划。但布林克博士死前下了一道限制，所以空迪因和陆迪因不得不以人类的形态活动。他们想夺取人造卫星武器“XV2”的力量，因此空迪因化身为“OSTO·Legacy”的白山静，前往天高找上了假面骑士部。她谎称需要借助假面骑士部的力量来阻止…

一直以来，假面骑士和超级战队守护着地球的和平，但这段历史即将被颠覆。假面骑士Decade成为“大修卡”的大首领向超级战队发动进攻，豪快红亦成为“大残虐”的大帝王对决假面骑士。而在两个组织的干部口中，提及着神秘的“大机器计划”…… 为了搞清楚这场战争的来龙去脉，假面骑士Fourze和Go-Busters乘坐Den-Liner回到过去……

一直以来，假面骑士和超级战队守护着地球的和平，但这段历史即将被颠覆。假面骑士Decade成为“大修卡”的大首领向超级战队发动进攻，豪快红亦成为“大残虐”的大帝王对决假面骑士。而在两个组织的干部口中，提及着神秘的“大机器计划”……为了搞清楚这场战争的来龙去脉，假面骑士Fourze和Go-Busters乘坐Den-Liner回到过去……

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