这是从异世界传承下光辉的姓名与竞跑能力的“马娘”、自久以来与人类共存着的世界的故事。从乡下转学到大都市的训中学园的马娘·特别周，与同学们互相切磋、赌上“日本第一马娘”的称号，目标：在“Twinkle系列”中的胜利！

“反转世界”是存在于这个世界内部的镜子般不可思议的世界。那个美丽而规则的世界，是骑拉帝纳栖居的特殊空间。然而帝牙卢卡和帕路奇犽的战斗造成了时空的扭曲，“反转世界”也因此完全被阴霾笼罩。由于自己的世界被污染而被激怒的骑拉帝纳找到了帝牙卢卡，并想将其拖入反转世界中。 　　“现实世界”，在继续旅行的小智和皮卡丘一行的面前出现…

这部以新奥地区为舞台的特别篇,除了小智和小豪之外,以小光为首的令人怀念的伙伴们出场,策划着神秘计划的银河队,被称为神的宝可梦·阿尔宙斯也即将登场。