一所位于东京都千代田区的传统高校“音乃木坂学院”，因为入读的学生人数骤减，所以正面临着废校的危机。其中有三名少女想到一条妙计——成为偶像，只要她们成为偶像，学校的名气便会增加，而入读学生的人数亦会上升。就这样，九位个性鲜明的少女决定一起努力成为偶像，希望可以凭借偶像的名气增加生源来挽救自己所喜爱的校园。

在超巨大综合动物园“Javari Park”里的神秘物质“Sandstar”的力量下，动物们接连变身成为拥有人类姿态的“动物娘”，她们开始与来访的人们热闹地游玩起来。有一天，动物园里出现了一个看上去很困扰的迷路孩子。本是为了回家而踏上的旅途，因为动物娘们的加入，变成了一场大冒险。