《阿U的烦恼第二季》通过一场场亦真亦幻的童话冒险以及父母和老师的帮助，孩子们的烦恼都得到了圆满解决。

本片描述了以阿U为主的一群小朋友，他们对于自然和社会生活充满好奇，并进行积极地探索，通过老师和家长的解答，了解了很多有趣的科学小知识。全片幽默搞笑又不失严谨的科学态度，让孩子们在欢笑中学到知识，真正做到寓教于乐。